Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHD4Q14839 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms