Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RFTN1Q14699 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFTN1Q14699 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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