Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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HNF4GQ14541 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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HNF4GQ14541 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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HNF4GQ14541 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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HNF4GQ14541 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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HNF4GQ14541 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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HNF4GQ14541 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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HNF4GQ14541 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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HNF4GQ14541 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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HNF4GQ14541 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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HNF4GQ14541 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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HNF4GQ14541 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
HNF4GQ14541 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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