Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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DDX39BQ13838 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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