Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL3Q13618 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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