Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MTMR3Q13615 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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