Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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FOXE3Q13461 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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FOXE3Q13461 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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FOXE3Q13461 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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FOXE3Q13461 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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FOXE3Q13461 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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