Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RPA4Q13156 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RPA4Q13156 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RPA4Q13156 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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