Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRDM2Q13029 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
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