Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BNIP3Q12983 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms