Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIN2AQ12879 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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