Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EP300Q09472 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EP300Q09472 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EP300Q09472 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EP300Q09472 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EP300Q09472 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EP300Q09472 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
EP300Q09472 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EP300Q09472 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EP300Q09472 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EP300Q09472 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EP300Q09472 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EP300Q09472 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EP300Q09472 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EP300Q09472 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EP300Q09472 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EP300Q09472 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms