Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CACNB2Q08289 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNB2Q08289 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms