Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SCN1BQ07699 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SCN1BQ07699 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms