Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms