Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms