Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABPB1Q06547 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms