Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPCQ03188 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms