Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms