Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HBBP68871 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HBBP68871 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
HBBP68871 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms