Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HERVK_113P63121 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms