Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPL23P62829 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPL23P62829 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPL23P62829 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPL23P62829 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RPL23P62829 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPL23P62829 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPL23P62829 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPL23P62829 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPL23P62829 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPL23P62829 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPL23P62829 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPL23P62829 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPL23P62829 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPL23P62829 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPL23P62829 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPL23P62829 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPL23P62829 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPL23P62829 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPL23P62829 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPL23P62829 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPL23P62829 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPL23P62829 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPL23P62829 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPL23P62829 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPL23P62829 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPL23P62829 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPL23P62829 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPL23P62829 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RPL23P62829 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RPL23P62829 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RPL23P62829 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms