Protein–RNA interactions for Protein: P57081

WDR4, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit WDR4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR4P57081 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
WDR4P57081 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
WDR4P57081 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR4P57081 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR4P57081 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR4P57081 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR4P57081 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR4P57081 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR4P57081 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR4P57081 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR4P57081 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR4P57081 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR4P57081 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR4P57081 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR4P57081 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR4P57081 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR4P57081 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR4P57081 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR4P57081 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR4P57081 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR4P57081 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR4P57081 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR4P57081 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR4P57081 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR4P57081 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR4P57081 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR4P57081 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR4P57081 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WDR4P57081 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms