Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSCP56915 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSCP56915 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GSCP56915 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GSCP56915 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GSCP56915 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSCP56915 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSCP56915 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSCP56915 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSCP56915 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSCP56915 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSCP56915 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSCP56915 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSCP56915 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSCP56915 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSCP56915 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSCP56915 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSCP56915 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSCP56915 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GSCP56915 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GSCP56915 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GSCP56915 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GSCP56915 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GSCP56915 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GSCP56915 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GSCP56915 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GSCP56915 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GSCP56915 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GSCP56915 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GSCP56915 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GSCP56915 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms