Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HIRAP54198 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HIRAP54198 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HIRAP54198 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HIRAP54198 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HIRAP54198 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HIRAP54198 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HIRAP54198 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIRAP54198 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIRAP54198 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIRAP54198 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIRAP54198 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIRAP54198 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIRAP54198 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIRAP54198 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIRAP54198 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HIRAP54198 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms