Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP53609 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms