Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTHFRP42898 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms