Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PIK3CBP42338 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PIK3CBP42338 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms