Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA1P42261 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms