Protein–RNA interactions for Protein: P40939

HADHA, Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHAP40939 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHAP40939 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHAP40939 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HADHAP40939 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HADHAP40939 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HADHAP40939 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HADHAP40939 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HADHAP40939 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms