Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJC1P36383 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GJC1P36383 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms