Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ACTN2P35609 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms