Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ECHS1P30084 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ECHS1P30084 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms