Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP5DP30049 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 682.3 ms