Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CRABP1P29762 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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