Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTGFP29279 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTGFP29279 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTGFP29279 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTGFP29279 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTGFP29279 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTGFP29279 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTGFP29279 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTGFP29279 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTGFP29279 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTGFP29279 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTGFP29279 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms