Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PCSK1P29120 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1P29120 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1P29120 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1P29120 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1P29120 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1P29120 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1P29120 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1P29120 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1P29120 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1P29120 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1P29120 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1P29120 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1P29120 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1P29120 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PCSK1P29120 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1P29120 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1P29120 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1P29120 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1P29120 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1P29120 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1P29120 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1P29120 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1P29120 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1P29120 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1P29120 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCSK1P29120 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms