Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NFKBIAP25963 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms