Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMO2P25791 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LMO2P25791 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMO2P25791 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMO2P25791 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms