Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2AP24928 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2AP24928 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms