Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TNNI3P19429 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms