Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC172P0C7W6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms