Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC4A1P02730 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms