Protein–RNA interactions for Protein: O95025

SEMA3D, Semaphorin-3D, humanhuman

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3DO95025 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SEMA3DO95025 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SEMA3DO95025 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SEMA3DO95025 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SEMA3DO95025 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SEMA3DO95025 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SEMA3DO95025 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEMA3DO95025 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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