Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCA5O60264 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms