Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHF1O43189 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PHF1O43189 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHF1O43189 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHF1O43189 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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