Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NDUFS4O43181 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NDUFS4O43181 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms