Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCAO15360 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCAO15360 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCAO15360 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCAO15360 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCAO15360 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCAO15360 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCAO15360 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCAO15360 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCAO15360 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCAO15360 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCAO15360 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCAO15360 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCAO15360 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCAO15360 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCAO15360 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCAO15360 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCAO15360 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCAO15360 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCAO15360 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCAO15360 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCAO15360 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCAO15360 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCAO15360 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCAO15360 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCAO15360 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCAO15360 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCAO15360 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCAO15360 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FANCAO15360 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FANCAO15360 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FANCAO15360 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FANCAO15360 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FANCAO15360 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FANCAO15360 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FANCAO15360 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCAO15360 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCAO15360 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCAO15360 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCAO15360 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCAO15360 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCAO15360 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCAO15360 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCAO15360 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCAO15360 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCAO15360 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCAO15360 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCAO15360 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCAO15360 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCAO15360 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCAO15360 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCAO15360 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCAO15360 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCAO15360 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCAO15360 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCAO15360 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCAO15360 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCAO15360 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCAO15360 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCAO15360 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCAO15360 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCAO15360 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCAO15360 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCAO15360 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCAO15360 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCAO15360 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCAO15360 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCAO15360 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCAO15360 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCAO15360 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCAO15360 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCAO15360 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCAO15360 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCAO15360 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCAO15360 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCAO15360 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCAO15360 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCAO15360 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCAO15360 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCAO15360 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCAO15360 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCAO15360 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCAO15360 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCAO15360 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCAO15360 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCAO15360 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCAO15360 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCAO15360 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCAO15360 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCAO15360 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCAO15360 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCAO15360 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCAO15360 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCAO15360 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCAO15360 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCAO15360 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCAO15360 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCAO15360 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCAO15360 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCAO15360 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms