Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
USP9YO00507 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USP9YO00507 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
USP9YO00507 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms