Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA2O00451 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms